Streptocarpus ionanthus是海角苣苔屬（Streptocarpus）物種，隸屬于苦苣苔科（Gesneriaceae），為肯尼亞和坦桑尼亞特有植物，具有很高的觀賞價值。該物種被分為9個亞種，通過亞種之間雜交，產生花色各異的品種，在美洲和歐洲市場廣受歡迎。 Str. ionanthus是Saintpaulia組中唯一生長在密林之外，受人為影響較嚴重的生境中的物種，導致種群數量逐漸下降，根據國際自然保護聯盟（ICUN）瀕危物種紅色名錄，該類群的Str. ionanthus subsp. rupicola，Str. ionanthus subsp. velutinus，Str. ionanthus subsp. grandifolius，Str. ionanthus subsp. orbicularis等處于瀕危狀態。前人對海角苣苔屬系統進化的研究中，利用核基因片段序列和葉綠體基因片段序列的一些研究，雖然取得了一些進展，但對于較低等級分類單元的分類處理上存在的問題，仍然沒有得到很好的解決。 

當前，在海角苣苔屬Saintpaulia組中僅有一個葉綠體基因組數據被報道，未見到該組中Str. ionanthus的基因組數據信息，重點實驗室博士研究生Cornelius Mulili Kyalo對收集于坦桑尼亞和肯尼亞的Str. ionanthus的五個亞種進行了葉綠體全基因組測序，分別為Str. ionanthus subsp. rupicola，Str. ionanthus subsp. velutinus，Str. ionanthus subsp. grandifolius，Str. ionanthus subsp. orbicularis，Str. ionanthus subsp. grotei，其基因組大小從153,208 bp（Str. ionanthus subsp. grandifolius）到 153,377 bp（Str. ionanthus subsp. orbicularis），均編碼115個基因。該研究與Saintpaulia組已報道的Str. teitensis進行比較結果顯示，基因的排列順序，基因組結構均表現出高度保守性，在四分結構中，IR區更為保守（圖 1）。研究通過IR邊界，以及序列上的微衛星（圖 2）等方面的比較，均表現出葉綠體基因組的保守性。

該研究從基因編碼區和基因間區，篩選出了五個可變區(psbM，rps3，atpF-atpH，psbC-psbZ，psaA-ycf 3），和五個具有大量多態性位點的基因（rps16，rpoC2，rpoB，ycf 1， ndhA），為進一步應用在系統發育研究中提供數據。該研究基于全基因組序列，蛋白編碼基因以及基因間區，利用最大似然法和貝葉斯推斷重建了物種的系統發育樹（圖 3），在三個系統樹中，基于有限的序列數據，五個亞種之間并未很好的分離，且分辨率仍不夠高，這與之前的研究結果較為相似。但該研究報道的Str. ionanthus五個亞種葉綠體基因組數據，為今后闡明其系統發育關系提供了重要的序列資源，相關的進一步研究正在進行中。  

研究成果以“The First Glimpse of Streptocarpus ionanthus (Gesneriaceae) Phylogenomics: Analysis of Five Subspecies’Chloroplast Genomes”為題，近期在線發表于國際學術期刊《Plants》上。 

論文鏈接：https://www.mdpi.com/2223-7747/9/4/456 

　　圖 1 基因組結構重排分析 

　　圖 2 微衛星比較分析 

圖 3 基于葉綠體全基因組、蛋白編碼基于以及基因間區構建的ML樹和BI樹