蓮是我國重要的水生經濟作物，包含溫帶型和熱帶型兩種主要生態類型，在我國南北方均有分布。其地下莖俗稱為藕，是一種重要的水生蔬菜。通常溫帶型蓮的地下莖會膨大成藕，而熱帶型蓮的地下莖不能膨大成藕。在育種生產過程中，將溫帶蓮和熱帶蓮分別互換生長環境，它們的地下莖仍然保持其在原產地的膨大特點。由此可見，蓮的地下莖膨大是受遺傳物質所控制的。因此開展蓮的膨大機理研究，不僅可以從分子生物學層面解釋不同品種的蓮藕的膨大機理，而且還可以應用這些研究結果為蓮藕的增產提供理論依據。
水生植物基因組學與遺傳育種學科組楊美副研究員在楊平仿研究員的指導下，利用轉錄組測序技術深入分析了溫帶蓮(ZO) 和熱帶蓮(RL) 兩個品種的地下莖在不同生長階段的基因的表達。通過深入分析差異基因的表達情況，發現大量差異表達的基因屬于碳水化合物代謝途徑和植物激素信號傳導途徑。該研究結果為進一步揭示蓮藕地下莖膨大機理奠定了堅實的基礎，相關研究結果已在線發表于Scientific Reports 雜志。
溫帶蓮和熱帶蓮的地下莖發育狀態
參與植物激素信號傳導的差異表達基因
