中國科學院植物種質創新與特色農業重點實驗室草坪種質資源學學科組孫小艷博士在傅金民研究員的指導下,以課題組收集的100份來源于33個國家地區的高羊茅種質材料,在武漢夏季進行兩輪高溫處理,對每份基因型材料的生長速率(GR),草坪質量(TQ),存活率(SR),葉綠素含量(CHL),蒸騰速率(ET)進行實時采集,構建高羊茅耐高溫功能性狀數據庫。并利用SSR標記技術完成了高羊茅群體結構分析和耐熱性狀關聯分析。結果表明5個功能性狀GR,TQ,SR,CHL和ET在高羊茅基因型間呈現顯著遺傳多樣性。從200對高羊茅EST-SSR標記中篩選出100對多態性標記,連接上FAM、HEX、ROX和TAMRA等熒光基團,利用ABI 3730測序儀進行SSR位點檢測,用Structure軟件對100份高羊茅進行群體結構分析,用Structure 2.2軟件的分群結果,在P<0.001的水平下將分1-3群的關聯分析結構的Q值分別做關聯分析。群體結構分析結果表明k=3時分群結果最佳。G1類群是最大的類群,包括91份高羊茅材料(包括23個商業品種和68份野生品種)。G2類群包括21個野生高羊茅材料,大部分來源于亞洲地區,G3類群最小,包含8份材料,其中5個野生高羊茅材料來源于非洲。基于Q + K混合模型,在兩輪試驗種分別鑒定有97 和 67個SSR位點與高羊茅耐熱性狀相關聯(P < 0.01)。
該研究獲得國家自然科學基金(Grant #: 31071822; 31470363)和國家863項目(Grant #: 2011AA100209-2)的支持。相關研究結果在植物學國際期刊BMC Plant Biology上在線發表(doi:10.1186/s12870-015-0494-5)。
基于Q ,K ,Q +K 三模型的葉綠素含量、草坪質量和生長速率
Quantile-quantile plots 分析
100份高羊茅種質材料的群體結構分析