蓮（Nelumbo nucifera Gaertn.）是我國重要的水生經濟作物，在我國南北方均有分布，經過栽培馴化，形成了藕蓮、花蓮和籽蓮三種不同的栽培類型。藕蓮品種主要是具有旺盛的地下莖分蘗和膨大能力，成熟期形成大量蓮藕；花蓮品種主要以具有各種不同花色、花型的花朵為園林造景提供材料；籽蓮品種則具有高開花率和結實率的特點，可以形成大量種子。蓮子心（種子的胚）有清心火、強心降壓功效；蓮子（堅果）有補脾止瀉、養心益腎功效。蓮子既可以成熟后收獲曬干做成各種蓮子制品，也可以新鮮采收作為一種時令水果。因此開展蓮子發育過程的研究，不僅可以從分子生物學層面闡述蓮子發育過程中各類蛋白質和其他代謝物質的動態變化，而且還可以結合這些研究結果為蓮子的適時采收提供理論依據。
水生植物基因組學與遺傳育種學科組碩士研究生傅金磊在楊平仿研究員的指導下同維也納大學博士生王蕾合作，綜合利用蛋白質組學和代謝組學技術分析授粉后第10至25天的蓮子中蛋白質和其他代謝物質的變化發現，在蓮子該發育過程中存在明顯的物質轉換，蓮子中可溶性糖含量在授粉后15天達到峰值，淀粉含量在授粉20天后開始顯著累積，這表明授粉后15-20天是蓮子鮮食的最佳時期。該研究工作獲得中科院知識創新工程：Y455421Z02和國家留學基金委:201206220134資助，相關研究結果已在線發表在 Frontiers in Plant Science。
水生植物基因組學與遺傳育種學科組博士研究生鄧嬌在楊平仿研究員指導下，利用我園蓮數據庫（http://lotus-db.wbgcas.cn.）中數據進行分析，發現蓮基因組中有255個MYB基因，其中有116個屬于R2R3MYB基因，并對這些基因進行結果和表達量分析。進一步分析這些基因在蓮不同組織中的表達量，發現13個MYB基因可能參與蓮類黃酮的合成代謝。這些研究結果為進一步揭示蓮花色形成機理提供基礎。該研究獲得中科院知識創新工程：Y455421Z02資助，相關研究結果已在線發表在Plant Molecular Biology Reporter。
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蓮子發育過程中的形態變化圖
蓮基因組中116個R2R3MYB基因與模式植物相應基因的系統進化分析
