水生環境與陸生環境有巨大的差異，大部分陸生植物不能在水生環境完成正常的生長、繁殖，對其而言，適應水生環境是巨大的挑戰。探討植物適應水生環境的機制一直是植物學領域的研究熱點之一。
毛茛屬起源于約 1800 萬年前，是植物界既有陸生又有典型沉水種類的最年輕類群之一，是研究植物適應水生環境的理想材料。在水生植物適應性進化學科組王青鋒研究員的指導下，陳凌云等人以該屬水生植物Ranunculus bungei，陸生植物R. sceleratus、R. brotherusii為材料，利用高通量測序平臺進行了轉錄組測序。通過Bidirectional Best Hit和OrthoMCL兩種方法篩選三個物種之間共有的直系同源基因，利用Approximate method和Maximum likelihood進行了選擇壓力分析，并對三個物種間的部分相關基因進行了統計和系統進化分析以及功能預測。研究結果表明，R. bungei在適應水生環境的過程中，有14個基因受到了正選擇壓力。這些基因與植物液泡蛋白的形成、調解植物水分運輸過程以及細胞骨架建成等相關，可能參與植物早期進入水生環境的形態建成。該研究為揭示植物適應水生環境的分子機理提供了重要線索，對于發掘提高農作物抗澇能力的基因具有指導意義。
該研究得到了中國科學院先導專項 (XDAO5090305)和國家自然科學基金(31300182)的資助。研究結果在線發表于Scientific Reports。
三個物種之間受正選擇壓力的基因列表
（紅色數字，如 ‘bun 9’指R. bungei-R. cantoniensis與R. bungei-R. brotherusii之間，共有9個來自于R. bungei的基因受到了正選擇壓力）
