美洲黃蓮‘AL1’遺傳連鎖圖譜
遺傳連鎖圖譜是研究植物基因組結構、進化的有力工具，是基因定位、克隆和分子標記輔助育種的重要基礎。但作為被子植物中起源最早的植物之一，且素有“活化石”之稱的蓮，其基因組學研究卻明顯滯后。因此，構建蓮遺傳連鎖圖譜有助于蓮基因組學研究的快速發展，為蓮重要經濟性狀的分離和克隆提供依據，從而有利于進一步探索和充分利用蓮的觀賞、食用和藥用價值。
水生植物資源學科組首先掃描了中國古代蓮基因組序列，發現了86,089個SSR位點，其中73,246個SSR位點可用于開發SSR引物。然后以亞洲蓮品種‘中國古代蓮’和美洲黃蓮品種‘AL1’雜交F1群體為材料，根據中國古代蓮基因組序列信息開發的部分SSR分子標記（500對）分別構建了‘中國古代蓮’和‘AL1’的遺傳連鎖圖譜。由于‘中國古代蓮’的基因組雜合度比較低，此圖譜僅包含7個連鎖群，有47個標記，圖譜長度為365.67 cM。‘AL1’圖譜包含11個連鎖群，有177個分子標記，圖譜長度為524.51 cM。這是首次報道蓮的遺傳連鎖圖譜，為蓮基因組學研究奠定了良好基礎，加快了蓮重要基因定位、克隆和分子標記輔助育種的進程。
該研究成果以“Genetic linkage maps for Asian and American lotus constructed using novel SSR markers derived from the genome of sequenced cultivar”為題在BMC Genomics（doi:10.1186/1471-2164-13-653）上在線發表。
（水生植物資源學科組 楊美韓 艷妮）
