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            研究進展

            武漢植物園在圓葉白粉藤適應性進化機制研究方面取得新進展

              圓葉白粉藤(Cissus rotundifolia)屬于葡萄科白粉藤屬多年生藤本植物,主要分布在非洲東部的稀樹草原、干旱和半干旱地區,為常綠攀緣植物,葉片肉質化,具有顯著的抗旱能力。 

              在中國科學院中-非聯合研究中心的組織下,武漢植物園王青鋒研究員團隊聯合中科院植物研究所、喬莫·肯尼亞塔農業與技術大學等機構,對圓葉白粉藤進行了全基因組解析適應性機制研究。采用二三測序和HiC技術相結合方法共獲得371.1Mb大小的基因組序列,scaffold N50達到27.6 Mb94.53 %序列被錨定12染色體上,共鑒定出30,824個蛋白編碼基因 

              研究發現圓葉白粉藤約在60.19–84.68百萬前與葡萄發生分化。其基因組并未發生獨立的加倍事件,其較小的基因組可能與約在9.7年前發生過一次轉座子爆發和有效偏好性的轉座子消除有關。與葡萄染色體的共線性以及祖先核型預測分析表明,圓葉白粉藤分化過程中發生過多次染色體重排染色體片段復制事件。與葡萄相比,圓葉白粉藤中顯著擴張的基因家族如:HSP-20, NBS-LRR等可能與其適應干旱生境有關景天科酸代謝途徑(CAM)關鍵展示出明顯的晝夜表達節律,支持了圓葉白粉藤中存在高水分利用效率的CAM代謝,為研究葡萄科中CAM途徑的起源提供了線索。此外,文章還就多肉植物在功能基因家族的共進化方面進行了分析和討論。 

              相關研究成果以A genome for Cissus illustrates features underlying the evolutionary success in dry savannas為題,在線發表在期刊Horticulture Research。辛海平研究員、王毅副研究員、李青云博士生、萬濤研究員為論文共同第一作者,植物研究所梁振昌研究員、美國國家自然歷史博物館文軍博士、武漢植物園王青鋒研究員為共同通訊作者。該研究得到國家自然科學基金(31961143026)、中科院中-非聯合研究中心研究專項(SAJC201614和SAJL201607)等項目的支持。 

              論文鏈接 

            圓葉白粉藤的形態特征和基因組進化   

            2 圓葉白粉藤的染色體重排 

            植物多樣性與進化學科組 李青云

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