NAC轉錄因子是植物特有的一類轉錄因子,在植物界廣泛存在,參與調節植物的各種生物學過程,例如器官發生、組織發育以及脅迫應答響應等。然而,蓮中NAC轉錄因子家族尚未報道。
近日,Frontiers in genetics發表了來自中國科學院武漢植物園蓮種質資源與遺傳育種學科組題為“Genome-Wide Characterization and Comprehensive Analysis of NAC Transcription Factor Family in Nelumbo nucifera”的文章。該研究在亞洲蓮的基因組中鑒定到82個NnNAC基因,并對這些NnNAC基因的序列特征、進化和轉錄激活活性等進行了分析。研究結果表明,同源基因對表現出相似的保守基序和基因結構特征。NnNAC蛋白廣泛的轉錄激活能力是由高度分化的C端激活域(AD)介導。該研究還鑒定到30和29個NnNAC候選基因分別參與蓮子發育進程和蓮水淹脅迫響應。本研究擴展了我們對NnNAC基因家族的認識,為今后蓮的分子育種和種質資源創新提供了重要的基因資源。
中國科學院武漢植物園在讀博士生宋賀云為論文的第一作者,中科院武漢植物園楊美研究員、孫恒助理研究員為該論文的通訊作者。本研究得到了國家自然科學基金、中國科學院生物資源計劃和湖北省自然科學基金的資助。
圖 蓮NnNAC基因組共線性和轉錄激活分析
(A)NnNAC基因組共線性關系。(B)NnNAC基因轉錄激活活性分析。(C)NnNAC基因結構域模式圖。