海洋藥物的應用由來已久，并在臨床應用中表現出獨特的優勢。在已獲FDA批準的海洋藥物中，蛋白-配體的相互作用，如阿糖胞苷-DNA聚合酶、腺苷環化酶和川芎嗪-微管蛋白復合物是其發揮功效的重要作用機制。然而，海洋藥用資源中由于成分復雜、靶點各異，其發揮生物活性的化學基礎和作用機制仍然難以揭示，對海洋藥物的發現和研發提出了巨大的挑戰，因而需要采用新的方法和技術進行更系統深入研究。分子對接（Molecular Docking）可以有效地預測蛋白配體復合物的結合模式和結合能，已成為計算機輔助藥物設計（CADD）的主要方法，有望在海洋藥物研究的許多方面發揮出重要作用。
基于上述研究背景，中國科學院植物種質創新與特色農業重點實驗室、武漢植物園植物化學生物學學科組副研究員陳桂林、博后Armel Jackson Seukep在郭明全研究員的指導下，較為系統介紹了分子對接的基本原理和軟件，并進一步闡釋了分子對接在海洋藥物發現與設計中的可能應用，包括藥物發現階段的早期虛擬篩選、藥物靶標發現、藥物潛在作用機制以及藥物代謝產物預測等。此外，論文還對分子對接在海洋藥物研發方面存在的問題進行了討論和展望，以期為海洋新藥的研究開發和臨床實踐提供更多的理論依據。
相關成果以“Recent Advances in Molecular Docking for the Research and Discovery of Potential Marine Drugs”為題，發表在藥物化學領域JCR TOP 30%國際學術期刊Marine Drugs上。該工作得到了國家自然科學基金（81673580、81903791）、中國科學院青年創新促進會（2020337）和湖北省自然科學基金（2019CFB254）的資助。
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圖1. 分子對接類型：a 鎖-鑰匙模型；b誘導-擬合理論。
