DNA序列差異的鑒定是解析重要生物學性狀的基礎。武漢植物園果樹分子育種學科組馬百全博士在韓月彭研究員的指導下,對30份蘋果種質資源進行了簡化基因組測序,獲得39,635個均勻分布在蘋果染色體上的單堿基多態性位點(SNPs)。
基于這些SNPs的遺傳學研究結果表明:蘋果野生種的遺傳多樣性顯著高于栽培蘋果,且栽培品種和野生種之間存在著雙向的基因流;栽培蘋果及其野生種連鎖不平衡(LD)衰減均非常快,關聯分析能實現蘋果基因的精細定位;栽培蘋果與蘋果野生種連鎖不平衡區域(LD block)分別不同,且栽培蘋果多數LD block位于果實品質性狀QTL區間內,揭示了果實品質在蘋果馴化過程中受到了選擇。
本研究得到國家自然科學基金(31420103914和31372048)資助,相關研究成果以封面論文的形式在Journal of Integrative Plant Biology 正式發表。
蘋果基因組中LD blocks分布示意圖