1月13日，湖北省政協副主席鄭心穗一行調研武漢植物園。
3月1日，鄂州市委副書記陳新林攜鄂州市有關部門和企業來武漢植物園考察洽談合作。
3月，劉潔鳴榮獲“湖北省級優秀工會工作者”榮譽稱號、鐘彩虹榮獲“湖北省女職工建功立業標兵”榮譽稱號。
3月，武漢植物園榮獲中科院體育協會頒發的“第四屆全民建身日活動先進單位 ”榮譽稱號。
3月22日，《肯尼亞植物志》中方編委第一次會議在武漢植物園順利召開。
4月，武漢植物園被武漢市科協核準并命名為“武漢市科普教育基地（2016-2020）”。
4月13日，湖北省政協常委、人口資源環境委員會副主任、省林業廳副廳長黃德華率省政協農業界別小組委員來園開展界別委員專題調研活動。
4月20日，中國科學院院長白春禮應邀率團訪問了埃塞1.俄比亞生物多樣性研究所。白春禮一行與相關人員就加強在生態環境及生物多樣性保護領域的合作以及專業技術人才的培養與交流等進行了座談，并實地考察了埃塞俄比亞植物種子庫和遺傳資源庫。
4月25日，中國科學院武漢植物園召開“兩學一做”學習教育再動員再部署工作會議。
5月，武漢植物園榮獲武漢市安全局授予的“國家安全人民防線信息工作優勝單位”榮譽稱號
5月6日，《2015年中國科學院信息化評估報告》發布，武漢植物園在全院98家參評的研究所中排名第3名，連續四年進入全院前三甲。
5月26日，2016年全國科普講解大賽在廣東科學中心拉開大幕。來自全國各地54個代表隊共計160名選手參加比賽，武漢植物園江珊榮獲三等獎。
6月30日，武漢植物園鐘彩虹研究員榮獲“中國科學院優秀共產黨員”表彰，并作為優秀黨員代表發言。
6月30日，中國科學院鄧麥村秘書長調研武漢植物園。
7月1日，為慶祝中國共產黨成立九十五周年，深入推進“兩學一做”學習教育，武漢植物園召開舉辦紀念建黨九十五周年表彰大會暨“兩學一做”學習教育專題黨課報告會。
7月6日，中國科學院劉偉平副書記一行調研武漢植物園。
7月7日，北京分院常務副院長、分黨組成員吳建國一行到武漢植物園，就后勤服務、院地合作等有關經驗及做法等方面進行調研。
7月，從中共湖北省委組織部獲悉，中國科學院武漢植物園向湖北省監利縣選派的科技副職梅林同志獲“湖北省第十一批優秀科技副縣（市、區）長”榮譽稱號。
7月，中國花卉協會荷花分會在江蘇揚州召開了“第三十屆全國荷花展覽會”，武漢植物園退休專家黃國振先生被授予“中國睡蓮終身成就獎”。
7月10日-15日，2016年大學生暑期夏令營活動在武漢植物園舉行。共有來自全國各高校的43名優秀營員參加，夏令營活動旨在增進高校優秀大學生對武漢植物園科研實力、學習環境和培養特色的了解,與相關學科領域的專家學者進行零距離交流,激發科研熱情和興趣。
7月18日，肯尼亞留學生Veronicah M. Ngumbau榮獲“第八屆中國民族植物學學術研討會暨第七屆亞太民族植物學論壇”優秀論文獎。
7月20日，武漢植物園召開園務會擴大會議，就中國科學院中-非聯合研究中心（以下簡稱“中-非中心”）“十三五”發展規劃、建設進程以及存在的問題與舉措進行深入研討。
7月，中國科學院大學公布了2016年度“中國科學院大學優秀來華留學生”評選結果。經報名申請、研究所推薦、中國科學院大學評審，武漢植物園污染生態學研究組肯尼亞籍留學生TERESIAH MUCIKU MUNGAI順利入選。
7月27日，“中國科學院中-非聯合研究中心”（“中-非中心”）第二屆理事會第一次會議在北京召開，會議由院國際合作局局長曹京華主持。會議審議并通過了由中科院副院長張亞平任理事長的“中-非中心”第二屆理事會成員組成。
8月5日，中國科學院副院長王恩哥應邀訪問了肯尼亞野生動物保護署（KWS）。KWS局長Mr Kitili Mbathi會見了代表團成員，對中科院代表團的來訪表示熱烈歡迎。雙方就肯尼亞野生動物保護，即將實施的反盜獵系統的合作以及野生動物飲水區的建設進行了友好深入商討。
8月11日，中國科學院副院長王恩哥應邀率團訪問了坦桑尼亞恩格羅恩格羅保護區管理局（NCAA）。中坦雙方就加強在生物多樣性保護等領域的合作以及專業技術人員的交流培養等問題進行了商討。
8月27-30日，由中國園藝學會獼猴桃分會主辦，蒼溪縣委、縣政府承辦的“第六屆全國獼猴桃研討會”在四川省蒼溪縣順利召開。涵蓋獼猴桃科研、種植、采后儲藏、交易經營全產業鏈的600余位獼猴桃行業從業者參加了本次會議。
9月13日，武漢植物園與江西省科學院在南昌簽署了科技戰略合作協議。雙方決定以具體科研項目合作研究為切入點，在江西省生態文明建設、鄱陽湖生態保護等領域開展全面合作。
9月15日-10月12日，應肯尼亞國家博物館館長 Mzalendo N. Kibunjia的邀請，武漢植物園王青鋒課題組一行7人（含肯尼亞留學生），訪問肯尼亞國家博物并按照預定方案組成中-肯聯合考察隊，對肯尼亞濱海省Ukunda地區進行了科學考察，中央電視臺非洲分臺進行了跟蹤報道。
9月24日，中國科學院青年創新促進會武漢分會（籌）（以下簡稱“武漢分會”）2016年學術年會在武漢植物園召開，武漢植物園主任張全發出席會議并致辭，武漢分會全體會員參加會議。
9月26日，由中國政府在肯尼亞援建的中-非聯合研究中心（以下簡稱中-非中心）項目在喬莫·肯雅塔農業科技大學（以下簡稱JKUAT）正式移交。
10月30日，中國科學院中-非聯合研究中心（簡稱中-非中心）第二屆學術委員會第一次會議在上海辰山植物園召開。第二屆學術委員會的全體委員、中-非中心各分中心負責人及部分科研骨干出席了會議。
11月，湖北省人力資源和社會保障廳公布了2016年度湖北省有突出貢獻中青年專家名單，武漢植物園韓月彭研究員獲批2016年度湖北省有突出貢獻中青年專家。
11月10日，園公共實驗平臺正式獲批中國科學院所級公共技術服務中心擇優支持。
11月17日，“中國植物園聯盟建設”項目總結驗收會議在中國科學院武漢植物園光谷園區召開。
11月18日，中科院武漢植物園60周年紀念暨學術會議在武漢植物園光谷園區隆重舉行。中科院武漢分院分黨組書記、副院長李海波、中科院屬（含雙管）植物園代表及武漢植物園歷任園領導、園領導班子成員、職工、學生及離退休代表、三老家屬代表等齊聚一堂，回首過去、總結歷史、暢想未來，共同紀念武漢植物園60周年華誕。
11月18-19日，中國科學院植物園2016年度工作會議暨學術論壇在中科院武漢植物園光谷園區舉行。
11月20日，中國植物園聯盟第一屆理事會第三次會議在中科院武漢植物園光谷園區召開。
11月23日，為加強學術交流，活躍學術思想，營造良好學術氛圍，以“植物&生態&生活”為主題的東湖“普蘭塔”首屆研究生學術論壇于在武漢植物園召開。來自武漢大學、華中農業大學、中國科學院水生生物研究所以及中國科學院武漢植物園的14名研究生做了論壇主題報告。
12月20日，中國科學院武漢植物園張莉俊獲得“全國科普先進工作者”的榮譽稱號。
12月，武漢植物園班小泉獲“中國科學院安全保衛保密先進工作者”稱號。
12月，2016年青少年高校科學營承辦單位總結研討會在東北大學召開，武漢植物園因表現優異獲得“杰出表現單位”榮譽稱號。
