植物代謝組學學科組
學科組致力于代謝組學分析、質譜數據庫構建、代謝組圖譜繪制、代謝組學與多學科交叉研究等方面的研究工作。目前，已繪制了首張衰老小鼠的腦代謝組圖譜，揭示了腦衰老的代謝基礎，為腦疾病及藥物調控的腦代謝研究提供了基準數據；構建了脂肪酸羥基脂肪酸酯（FAHFA）衍生物的計算機模擬二級質譜圖數據庫，收錄了4000余種FAHFA衍生物的結構及譜圖信息；發展了油菜素甾醇、多胺、赤霉素等重要植物代謝物的高靈敏高通量分析方法。相關研究成果發表于Nature Communications, Analytical Chemistry、Analytica Chimica acta等期刊上，被引2000余次。
研究組長
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姓 名 | 丁俊 | 學 歷 | 博士 |
| 職 稱 | 研究員 | 職 務 | 博士生導師, PI | |
| 通訊地址 | 武漢市東湖新技術開發區九峰一路201號 | |||
| 郵政編碼 | 430074 | 電子郵箱 | dingjun@wbgcas.cn | |
| 姓 名： | 丁俊 |
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| 學 歷： | 博士 |
| 職 稱： | 研究員 |
| 職 務： | 博士生導師,PI |
| 通訊地址： | 武漢市東湖新技術開發區九峰一路201號 |
| 郵政編碼： | 430074 |
| 電子郵箱： | dingjun@wbgcas.cn |
簡要履歷
| 2022年-至今 | 中國科學院武漢植物園，研究員，博士研究生導師 |
| 2019年-2020年 | 加州大學戴維斯分校，基因組中心、NIH西海岸代謝組學中心，博士后 |
| 2018年-2019年 | 芝加哥大學, Ben May癌癥研究中心，博士后 |
| 2017年-2021年 | 武漢大學，化學與分子科學學院，分析科學研究中心，副研究員 |
| 2015年-2017年 | 武漢大學，化學與分子科學學院，分析科學研究中心，講師 |
| 2014年-2015年 | 中國科學院武漢植物園，助理研究員 |
| 2009年-2014年 | 武漢大學，化學與分子科學學院，分析化學博士 |
| 2005年-2009年 | 中山大學，化學與化學工程學院，學士 |
社會任職
- Frontiers in Chemistry special issue “Recent Application of Nanomaterials in Sample Preparation”客座編輯；
- Analytical Chemistry, Analytica Chimica Acta, Journal of Chromatography A, 《分析科學學報》審稿人；
- Grant proposal for the National Science Center, Poland評審人。
研究組科研項目
- 中國科學院高層次人才項目（2023-2026），項目負責人；
- 湖北省青年拔尖人才培養計劃（2023-2025），項目負責人；
- 國家自然科學基金面上基金項目(2021-2024)，基于化學衍生-計算機模擬二級質譜圖數據庫策略的酰基輔酶A全分析方法研究，項目負責人；
- 國家自然科學基金青年基金項目(2017-2019)，基于富勒烯衍生物的MALDI-MS反應性基質研究及其在生物活性小分子快速檢測中的應用，項目負責人；
- 中央高校基本科研業務費專項資金(2016-2017)，基于尿肌氨酸的前列腺癌早期診斷方法研究，項目負責人。
研究組代表成果
代表性論文：
- Ding J , Feng YQ. 2023. Mass spectrometry-based metabolomics for clinical study: Recent progresses and applications. TrAC Trends in Analytical Chemistry, 158: 116896.
- Sun J#, Ding J#, Shen Q, Wang X, Wang M, Huang Y, Zhang X, Zhu H, Zhang F, Wu D, Peng M, Zhang Z, Yuan Y, Li W, She ZG, Zhang X, Li H, Zhang P*, Huang Z*. 2023. Decreased propionyl-CoA metabolism facilitates metabolic reprogramming and promotes hepatocellular carcinoma. Journal of Hepatology, DOI 10.1016/j.jhep.2022.11.017. (#Co-first author)
- Ding J, Ji J, Rabow Z, Shen T, Folz J, Brydges C, Fan S, Lu X, Mehta S, Showalter M, Zhang Y, Araiza R, Bower L, Lloyd K, Fiehn O*. 2021. A Metabolome Atlas of the Aging Mouse Brain. Nature Communications, 12: 6021.
- Ding J, Kind T, Zhu QF, Wang Y, Yan JW, Fiehn O*, Feng YQ*. 2020. In-Silico-Generated Library for Sensitive Detection of 2-Dimethylaminoethylamine Derivatized FAHFA Lipids Using High-Resolution Tandem Mass Spectrometry. Analytical Chemistry, 92: 5960-5968.
- Yu L, Ding J*, Wang YL, Liu P, Feng YQ*. 2015. 4-Phenylaminomethyl-benzeneboric acid modified tip extraction for determination of brassinosteroids in plant tissues by stable isotope Labeling–Liquid Chromatography–Mass spectrometry. Analytical Chemistry, 88: 1286-1293.
- Ding J, Chen G, Chen G*, Guo M*. 2019. One-Pot Synthesis of Epirubicin-Capped Silver Nanoparticles and Their Anticancer Activity against Hep G2 Cells. Pharmaceutics, 11: 123.
- Ding J, Xiao HM, Liu S, Wang C, Liu X, Feng YQ*. 2018. A matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry method for the analysis of small molecules by integrating chemical labeling with the supramolecular chemistry of cucurbituril. Analytica Chimica Acta, 1026: 77-86.
- Ding J, Liu S, Xiao HM, Ye TT, Zhou P, Feng YQ*. 2017. Matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry for the analysis of polyamines in plant micro-tissues using cucurbituril as a host molecule, Analytica Chimica Acta, 987: 56-63.
- Ding J, Luo XT, Yao YR, Xiao HM, Guo MQ*. 2017. Investigation of changes in endocannabinoids and N-acylethanolamides in biofluids, and their correlations with female infertility. Journal of Chromatography A, 1509: 16-25.
- Ding J, Mao LJ, Guo N, Yu L, Feng YQ*. 2016. Determination of endogenous brassinosteroids using sequential magnetic solid phase extraction followed by in situ derivatization/desorption method coupled with liquid chromatography–tandem mass spectrometry. Journal of Chromatography A, 1446: 103-113.
- Ding J, Wu JH, Liu JF, Yuan BF, Feng YQ*. 2014. Improved methodology for assaying brassinosteroids in plant tissues using magnetic hydrophilic material for both extraction and derivatization. Plant methods, 10: 39.
- Ding J, Mao LJ, Yuan BF, Feng YQ*. 2013. A selective pretreatment method for determination of endogenous active brassinosteroids in plant tissues: double layered solid phase extraction combined with boronate affinity polymer monolith microextraction. Plant Methods, 9: 13.
- Ding J, Mao LJ, Wang ST, Yuan BF, Feng YQ*. 2013. Determination of Endogenous Brassinosteroids in Plant Tissues Using Solid‐phase Extraction with Double Layered Cartridge Followed by High‐performance Liquid Chromatography–Tandem Mass Spectrometry. Phytochemical Analysis, 24: 386-394.
- Ding J, Gao Q, Li XS, Huang W, Shi ZG, Feng YQ*. 2011. Magnetic solid‐phase extraction based on magnetic carbon nanotube for the determination of estrogens in milk. Journal of separation science, 34: 2498-2504.
- Ding J, Gao Q, Luo D, Shi ZG, Feng YQ*. 2010. n-Octadecylphosphonic acid grafted mesoporous magnetic nanoparticle: Preparation, characterization, and application in magnetic solid-phase extraction. Journal of Chromatography A, 1217: 7351-7358.
- Xiong CF, Ding J#, Zhu QF, Bai YL, Yin XM, Ye TT, Yu QW, Feng YQ*. 2021. Boron Isotope Tag-Assisted Ultrahigh-Performance Liquid Chromatography Coupled with High-Resolution Mass Spectrometry for Discovery and Annotation of cis-Diol-Containing Metabolites. Analytical Chemistry, 93: 3002–3009. (#Co-first author)
- Wu P, Xiao HM, Ding J*, Deng QY, Zheng F, Feng YQ*. 2017. Development of C60-based labeling reagents for the determination of low-molecular-weight compounds by matrix assisted laser desorption ionization mass (I): Determination of amino acids in microliter biofluids. Analytica Chimica Acta, 960: 90-100.
- Chen D, Ding J#, Wu MK, Zhang TY, Qi CB, Feng YQ*. 2017. A liquid chromatography–mass spectrometry method based on post column derivatization for automated analysis of urinary hexanal and heptanal. Journal of Chromatography A, 1493 ： 57-63. (#Co-first author)
- He XM, Ding J*, Yu L, Hussain D, Feng YQ*. 2016. Black phosphorus-assisted laser desorption ionization mass spectrometry for the determination of low-molecular-weight compounds in biofluids. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 408: 6223-6233.
- Zhang D, Tang Z, Huang H, Zhou G, Cui C, Weng Y, Liu W, Kim S, Lee S, Perez-Neut M, Ding J, etc., Zhao YM*. 2019. Metabolic regulation of gene expression by histone lactylation. Nature, 574: 575-580.
- Fang Y, Xu X, Ding J, Yang L, Doan MT, Karmaus PWF, Snyder NW, Zhao Y; Li JL, Li X*. 2021. Histone crotonylation promotes mesoendodermal commitment of human embryonic stem cells. Cell Stem Cell, 28: 748-763.
- Zhu Z, Han Z, Halabelian L, Yang X, Ding J, Zhang N, Ngo L, Song J, Zeng H, He M, Zhao Y, Arrowsmith CH, Luo M, Bartlett MG, Zheng YG*. 2021. Identification of lysine isobutyrylation as a new histone modification mark. Nucleic Acids Research, 49: 177-189.
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姓 名 | 劉葉 | 學 歷 | 博士 |
| 職 稱 | 助理研究員 | 職 務 | ||
| 通訊地址 | 武漢市東湖新技術開發區九峰一路201號 | |||
| 郵政編碼 | 430074 | 電子郵箱 | liuye@wbgcas.cn | |
| 姓 名： | 劉葉 |
|---|---|
| 學 歷： | 博士 |
| 職 稱： | 助理研究員 |
| 職 務： | |
| 通訊地址： | 武漢市東湖新技術開發區九峰一路201號 |
| 郵政編碼： | 430074 |
| 電子郵箱： | liuye@wbgcas.cn |
簡要履歷
2017年于華中科技大學同濟醫學院獲得博士學位，2019進入中國科學院武漢植物園工作。目前主要進行天然產物活性成分分析、分離鑒定，以及基于代謝組學的藥物作用機制研究。已在Journal of natural products, Antioxidants, Journal of functional foods等學術期刊上已發表論文10余篇，主持國家自然科學基金和湖北省自然科學基金各1項。
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姓 名 | 余金輝 | 學 歷 | 博士 |
| 職 稱 | 助理研究員 | 職 務 | ||
| 通訊地址 | 武漢市東湖新技術開發區九峰一路201號 | |||
| 郵政編碼 | 430074 | 電子郵箱 | yujinhui@wbgcas.cn | |
| 姓 名： | 余金輝 |
|---|---|
| 學 歷： | 博士 |
| 職 稱： | 助理研究員 |
| 職 務： | |
| 通訊地址： | 武漢市東湖新技術開發區九峰一路201號 |
| 郵政編碼： | 430074 |
| 電子郵箱： | yujinhui@wbgcas.cn |
簡要履歷
博士畢業于中國科學院大學, 2022年進入中國科學院武漢植物園工作，目前擔任植物代謝組學學科組特別研究助理，主要負責多組學大數據分析和數據庫構建等方面的工作。 已在Fuel、Combustion and Flame、Journal of Chemical Information and Modeling、Journal of Microbiology 和 Marine Drugs 等學術期刊上發表多篇論文。
