儀器的基本信息:
儀器名稱:雙向熒光差異凝膠電泳系統(2D-DIGE) 及分析軟件
英文名稱:Two-dimensional fluorescence difference in gel electrophoresis,2D-DIGE and analysis software
型 號:
Ettan DIGE 2D & DeCyder
購買年份:2012年
存放地點:公共實驗平臺
管理人員:陳麗
產 地:瑞典制 造 商:
GE聯系電話:027-87700819
儀器的用途:
熒光差異蛋白表達分析系統在傳統雙向電泳技術的基礎上,結合了多重熒光分析的方法,在同一塊膠上共同分離多個分別由不同熒光標記的樣品,并第一次引入了內標的概念,極大地提高了結果的準確性,可靠性和重復性。在DIGE技術中,每個蛋白點都有它自己的內標,并且軟件全自動根據每個蛋白點的內標對其表達量進行校準,保證所檢測到的蛋白豐度變化是真實的。DIGE技術可檢測到樣品間小于10%的蛋白表達差異,統計學可信度達到95%以上。采用DIGE技術,通過對不同類型,不同個體的細胞、組織、或經過不同處理和不同生長條件下蛋白質表達差異分析,在分子生物學及蛋白質功能研究等方面都有廣泛的應用。
儀器的技術參數:
1 熒光差異凝膠分析軟件
1.1全自動進行多色熒光圖像的找點、背景扣除、凝膠之間匹配和蛋白點分析。
1.2找點過程無需人工圖像編輯,確保同一凝膠上不同熒光素標記的圖像中相同點大小形狀完全一致。
1.3同一凝膠上不同熒光素標記的圖像不需要匹配,膠之間的匹配通過內標的匹配來實現,確保實驗結果精確性。
1.4采用內標的方法全自動進行每個點和每個差異的統計學分析和數據歸一化。
1.5有批處理功能,最多可以處理≥500對圖像。
1.6可信度可達>95%的情況下,常規檢測到10%的蛋白表達差異。
1.7 膠內差異分析模塊(DIA):檢測一塊膠中完全重疊的三幅圖像,采用專利算法進行共找點,得到一致精確的比值計算
1.8 生物學差異分析模塊(BVA):在凝膠之間進行匹配。并檢測所有凝膠上樣品之間的差異,應用統計學計算每個差異的可信度水平
1.9擴展數據分析模塊(EDA),對BVA數據進行高端統計分析,通過生成不同的數據組,快速分析DIGE數據
1.10軟件中界面中的凝膠視圖、點發布圖、3D視圖與數據表格之間具有動態鏈接。
1.11 采用數據庫Oracle進行數據管理,確保數據安全性。
1.12對每個點都進行 t-檢驗,1way 和 2 way ANOVA 統計
1.13 軟件版本為7.0版
2 第一向等電聚焦電泳系統 Ettan IPGphor 3
2.1 功率:12W ;電壓:0 - 10000 V
2.2 電極區:銅鍍金表面
2.3 膠條槽容量:最多12 個相同長度的膠條槽
2.4 程序參數:溶脹時間, 電泳平臺溫度, 每根膠條最大電流極限, 升壓設定, 電壓上升模式和電壓持續時間。主機可生成10個方法, 每個方法可以多達 9步;通過電腦可以生成、存儲和編輯任何數目的方法
3 大型垂直電泳槽
3.1 凝膠容量:在一個電泳槽中同時運行 1 到 6 塊膠,適合7-24cm任何長度的一向膠條
3.2 最大凝膠尺寸:26 x 20cm, 1.0mm 厚
3.3 電泳緩沖液體積:陽極:4.5 升;陰極:0.8升
3.4 內置緩沖液循環泵,流速10L/min
3.5 制冷:通過陶瓷熱交換器
3.6 灌膠模具:一次同時灌 1到 6塊膠,內含分隔片和填充片,方便卸膠,節省膠液